用工单位在认定工伤时需要遵循以下步骤：

1. 确认劳动关系：需要确认员工与用工单位之间是不是存在事实劳动关系。

2. 工伤认定条件：按照《工伤保险条例》第十四条职工在工作时间和工作场所内因工作起因受到事故伤害的，理应认定为工伤。

3. 提交申请：用工单位或员工本人需向当地社会保险行政部门提交工伤认定申请并提供相关证据材料。

4. 调查核实：社会保险行政部门对工伤认定申请实调查核实，包含现场调查、询问证人等。

5. 作出决定：社会保险行政部门按照调查结果，作出是否认定为工伤的决定。

6. 不服申诉：倘使员工或用工单位对工伤认定结果不服，可以在规定时间内向上一级社会保险行政部门提出申诉。

7. 赔偿与待遇：一旦认定为工伤，员工将享受相应的工伤保险待遇，用工单位需承担相应的赔偿责任。