层层转包中的工伤认定遵循以下原则：

1. 确定工伤主体：在层层转包的情况下理应由具备用工主体资格的发包方或承包方承担工伤保险责任。具体认定工伤责任时以下序号步骤可供参考：

- 之一步：确认受伤员工与各转包单位之间的劳动关系。依照《工伤保险条例》和相关法律规定应由具备用工主体资格的发包方或承包方承担工伤赔偿责任。

- 第二步：从下往上追溯，找到之一个具备用工主体资格的企业。若是更低层级的承包方不具备用工主体资格，则应逐级向上追溯，直到找到具备资格的单位。

- 第三步：提交工伤认定申请，包含工伤认定申请表、劳动关系证明材料以及医疗诊断证明等。倘若申请人材料不完整社会保险行政部门将告知需要补正的材料。

- 第四步：按照《工伤保险条例》的规定，假若员工在上下班途中遭受非本人主要责任的交通事故等伤害，应认定为工伤。

- 第五步：具备用工主体资格的单位应对工伤员工承担赔偿责任，即使实际工作是由不具备资格的转包方实行的。

层层转包中的工伤认定需要从确定工伤主体、追溯具备用工主体资格的单位、提交申请、认定工伤到承担赔偿责任等步骤逐一实行。