工伤认定程序的合法性主要涵以下几个方面：

1. 申请材料完整：申请人需依照规定提交工伤认定申请表、劳动关系证明、医疗诊断证明等相关材料。

2. 及时受理：社会保险行政部门应在收到完整材料后的规定时间内（如十日内）受理工伤认定申请。

3. 调查核实：劳动保障行政部门应该对事故情况实行调查核实涵事故发生的时间、地点、起因以及职工伤害程度等。

4. 依法认定：依据《工伤保险条例》和相关法律法规对是不是合工伤认定的条件实判断。

5. 决定书规范：工伤认定决定书理应载明用人单位全称、职工信息、受伤情况、认定依据、认定结论等必要内容，并加工伤认定专用印章。

6. 行政复议：对不服工伤认定决定的，应告知申请行政复议的部门和期限，保障当事人的合法权益。

7. 程序透明：工伤认定过程理应公开透明，保证认定结果的公正性和合法性。

8. 材料补正：假使申请人提供的材料不完整，劳动保障行政部门理应一次性书面告知需要补正的全部材料并在补正后及时受理。

9. 时效保障：对工伤认定的时效需求，必须严格遵守，确信认定程序的及时性。

10. 权利告知：在工伤认定期间，应充分告知职工和用人单位各项权利和义务保证双方的权益得到保障。